Ada beberapa sumber beasiswa yang diberikan kepada mahasiswa UT Tarakan, antara lain:

1. Beasiswa bidikmisi (beasiswa untuk  lulusan SLTA/SMK berprestasi tapi tidak mampu) yaitu : 23 mhs Agribisnis (registrasi pertama 2019.1) di Kabupaten Malinau;
2. Beasiswa CSR Bank Mandiri yaitu 22 mhs Akuntansi (Registrasi pertama 208.2) di Tanjung Selor;
3. Beasiswa Pemkab Malinau yaitu 50 mahasiswa PGSD (Registrasi pertama 2019.1);
4. Beasiswa PPA (peningkatan prestasi akademik) setiap tahun dengan sistem kompetisi, langsung dikelola oleh kantor Wakil Rektor 3 (IPK minimal 3,00);
5. Beasiswa Kaltara Cerdas setiap tahun dengan sistem kompetisi, langsung dikelola oleh Pemprov Kaltara (khusus untuk mhs UT Tarakan IPK minimal 2,20).

Adapun cara untuk mendapatkan beasiswa PPA  dan beasiswa Kaltara Cerdas adalah harus menjadi mahasiswa UT Tarakan minimal semester 2 dan memenuhi IPK yang dipersyaratkan.